《武僧进城》讲述了侦探萧明意外卷入一桩杀人案的故事。接到神秘电话后，他遭到各方黑暗势力追逼，为证明自己的清白，萧明先以花言巧语取得拳击馆老板的信任，随后历经重重险阻，终于从虎穴中逃脱。逃亡途中，他偶然遇见正在被拳击馆老板追赶的三个和尚和一名女孩。危急关头，悟明和尚拦下萧明的汽车，几人仓皇离开。经过交谈，萧明得知了三名和尚下山的真正目的。
原来，日本黑帮头目胜平二郎曾派手下胜平史蒂芬前往少林寺盗取一本秘笈，却没想到胜平史蒂芬在返程途中丧命，秘笈也随之失踪。为查明真相，胜平二郎又派杀手花也真衣展开调查。偏偏此时，胜平二郎的女儿又离奇失踪，花也真衣究竟遭遇了什么，才会最终放弃一切、落荒而逃？作为胜平二郎亲信的小黑二郎，是否一直在暗中操控这一切？三个少林武僧又能否夺回本属于自己的东西？
