B计划讲述日本第一通缉犯、恐怖组织“圣众之道”的首脑吉永英明在香港被扣留后引发的一场国际犯罪危机。香港督察Ken（张智霖 饰）与女友Anita（舒淇 饰）回家途中，偶然遇到吉永英明手下盗取化学品后遗弃、并在路面失控的卡车，Ken也因此被卷入事件之中。
为了引渡吉永英明，曾在他手下吃过大亏的鹰见探员（泽田谦也 饰）一行通过领事馆与香港警方交涉。然而，吉永的手下随后抵达香港，并以沙林毒气威胁警方，企图营救首领。为维护香港作为国际金融中心的声誉，程督察（李绮红 饰）等警员试图低调平息事态，同时通缉擅自追查“圣众之道”的Ken和鹰见。面对穷凶极恶的罪犯，Ken与鹰见决定不惜一切代价将其绳之以法。
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