《你好，我的大夫国语》讲述了中医系毕业的程嘉应（蔡思贝饰）行医以来表现出色，长期位居每月接诊病人最多的医师之首，善于将有限资源发挥到最大效用。晋升为高级中医师后，她负责管理诊所，并开始培训初级中医师。没想到，新入职的初级中医师中竟有她的青梅竹马、同届中医同学兼前度男友辜清劲（何广沛饰）。
多年前，两人因性格和价值观不合而分手，如今重逢后成为上司与下属，矛盾冲突不断。然而，他们始终秉持医者仁心，以病人的利益为先。辜清劲到医院参与中西医协作治疗时遭受不公平对待，最终程嘉应与一众初级中医师一同离开政府诊所。众人怀着共同的理想开设私人中医诊所，在面对形形色色的病人和各种奇难杂症时，不仅医术有所精进，也逐渐对人生有了不同体会。
程嘉应与辜清劲旧情复燃，却又因现实问题、经营方针及理念差异而不断发生冲突。最终，辜清劲退出诊所，成为一名游牧医师。两人在各自的道路上继续坚持自己的医疗理念，直到程嘉应患上红斑狼疮症，辜清劲参与她的中西医结合治疗。在这场生死关头的考验中，两人才发现理想与现实是每个...
