山田君与7个魔女的故事发生在私立朱雀高校。山田龙（逢坂良太配音）是学校里出了名的不良少年，老师和同学见到他都恨不得绕道而行，而他自己也早已厌倦了枯燥又充满束缚的校园生活。一次意外中，山田龙竟与优等生白石丽（早见沙织配音）交换了身体，并因此发现了白石丽深埋心底的秘密。在同级生宫村虎之介（增田俊树配音）的怂恿下，他加入了超自然研究部。部员中还有热衷超自然事件的伊藤雅（内田真礼配音），以及同样是不良少年的椿剑太郎（佐佐木寿治配音）。随后，几人在腹黑的学生会会长山崎春马（福山润配音）的要求下，开始调查校园里有关魔女的事件，也由此踏入了一个全新的世界。
