《女武神驱动》的故事发生在一座名为“MERMAID”的人工岛上。处女守（井泽美香子 配音）刚被送到岛上不久，便遭到了敌人的袭击。危急时刻，金发少女敷岛魅零（井口裕香 配音）及时现身迎战。然而敌人实力强大，即使是魅零也逐渐难以招架。就在形势万分紧迫之际，魅零突然吻了守。令守难以置信的是，她竟然化身为一柄长刀，成为魅零手中的武器。凭借两人的配合，她们最终击败了敌人。
原来，这座岛上还生活着许多与守拥有相同命运的人，其中包括性格大大咧咧的守财奴樱美凤（久保由利香 配音）、英俊潇洒的柊晶（芳野由奈 配音），以及我行我素、无人能够管束的莲实玲音（大西沙织 配音）。尽管性格各异，她们都有着同一个目标——逃离这座岛屿。
