《十二金牌》的故事发生在南宋时期。岳飞率军北上抗击金兵，奸臣秦侩暗中与金人勾结，伪造圣旨和金牌，企图送到岳飞手中，逼迫他率军回朝。华山剑侠苗龙（岳华 饰）得知秦侩的阴谋后，带领一众能人志士在途中截取金牌，并阻止聚贤堂派出的刺客刺杀岳飞。
聚贤堂失去主人后，秦侩找来华山一剑金彦堂（井淼 饰）担任新堂主，实际上是想将他变成受自己操控的傀儡。金彦堂既是苗龙的师父，而他的女儿金铄（秦萍 饰）也一直深爱着英俊潇洒的苗龙。秦侩并未放弃送出金牌的计划，继续在暗中布局。苗龙得知师父金彦堂与秦侩之间的关系后，只能背叛师门，也斩断了与金铄之间的感情，使不明真相的金铄陷入深深的痛苦之中。
