《数码宝贝剧场版5：冒险者的战斗》讲述了一个发生在暑假里的故事。启人（津村真琴配音）为了扫墓来到风景秀美的冲绳，并在海边与阿海（佐伯鹏配音）一起救下了遭到数码兽袭击的少女美波（三石琴乃配音）。那些数码兽似乎正盯上美波随身携带的笔记本电脑，而电脑中究竟隐藏着什么秘密，也让启人十分在意。
更令人意外的是，美波遭遇危险之际，竟促成了数码宝贝石狮兽（津久井教生配音）的诞生。它肩负着怎样的使命？随着调查深入，启人发现，风靡全球的电子宠物V-Pet背后隐藏着一个惊人的阴谋。贪婪邪恶的曼法斯兽妄图借助虚拟数码兽摧毁人类世界，并建立属于自己的数码世界。面对这个强大的敌人，启人与伙伴们将如何迎战？
