《超迷你战士第二季》继续讲述迷你勇和迷你萌对抗烦恼星人的故事。体力太差、跑不动，或是总丢三落四，这些困扰人类的问题，可能并非自身造成，而是烦恼星人暗中制造的。智商高达500的女娃博士运用勇气与快乐能量创造出超迷你战士，帮助人类消除烦恼。虽然在大决战中暂时击退了可恶的烦恼星人，更强大的新烦恼星人却接踵而来，据说他从不犯错，堪称完美。与此同时，女娃博士也迎来了新的挑战：一个拥有红色头发、不可一世、号称地表最强的小学生强势出现。他究竟是敌人还是朋友？面对不断出现的烦恼和挑战，迷你勇与迷你萌勇敢迎战，在努力进化自己的同时，持续为人类而战。有烦恼，就快呼叫超迷你战士，一起打败烦恼！
